Om mig
Grundexamen i Biomedicin från KI 1999, doktorsexamen i onkologi och experimentell onkologi 2004, docent i experimentell patologi och f.n. forskare på institutionen för medicinsk biokemi och biofysik (MBB), verksam på SciLifeLab i Solna, Karolinska Institutet i Stockholm. Undervisar läkarstudenter (DFM1) och biomedicinstudenter i biokemi, handleder doktorander och post-doktorer i gruppen, samt föreläsningar på doktorandkurser. Många uppdrag inom internationell peer review av artiklar, forskningsansökningar och som editor för tidskrift m.m.
Forskningsbeskrivning
Vår målsättning är att utforska tilverkningen av ribosomer i normala och cancerceller, samt om möjligt omsätta denna kunskap i utvecklingen av nya, mer eller mindre, målstyrda terapier mot cancer.
Vi är särskilt intresserad av molekylära mekanismer som ligger till grund för reglering av ribosombiogenes, hur cellen känner av fel i denna komplexa process och hur fördjupad kunskap om denna i sin tur kan implementeras i utvecklingen av bättre anti-cancerterapier. För att undersöka ribosombiogenes och nukleolen använder teamet olika mikroskopitekniker, ribosomprofilering, rDNA-analyser, zebrafisk, transkriptomik, translatomik och proteomik bland annat i samverkan med olika core-faciliteter på bl a SciLifeLab. Vi arbetar också mycket med små molekyler och siRNA screens.
Huvudlinjer inom forskningen: 1. Karaktärisering av ribosombiogenes reglerande proteiner och deras potentiella roll i cancerutveckling och möjlighet som måltavla vid anti-cancer terapi 2. Reglering av ribosombiogenes i normal utveckling och i uppkomst av hjärntumörer. Ribosomala skillnader i relation till cellulär mångfald i höggradiga gliom. Även signaleringsmolekyler och transkriptionsfaktorer som styr gliomens egenskaper, tillväxt och tillstånd 3. Betydelse och reglering av ribosom biogenes, sammansättning, och nukleolens struktur och funktion i cancer. 4. Funktionella studier av enskilda ribosomala proteiner.
Selekterade referenser nedan, för en mer komplett lista hänvisas till ORCID, Researchgate, eller Pubmed.
Actionable cancer vulnerability due to translational arrest, p53 aggregation and ribosome biogenesis stress evoked by the disulfiram metabolite CuET. Kanellis DC, Zisi A, Skrott Z, Lemmens B, Espinoza JA, Kosar M, Björkman A, Li X, Arampatzis S, Bartkova J, Andújar-Sánchez M, Fernandez-Capetillo O, Mistrik M, Lindström MS, Bartek J Cell Death Differ 2023 May;():
Small Molecule-mediated Disruption of Ribosome Biogenesis Synergizes With FGFR Inhibitors to Suppress Glioma Cell Growth. Zisi A, Kanellis DC, Moussaud S, Karlsson I, Carén H, Bräutigam L, Bartek J, Lindström MS Neuro Oncol 2022 Dec;():
Targeting Ribosome Biogenesis in Cancer: Lessons Learned and Way Forward. Zisi A, Bartek J, Lindström MS Cancers (Basel) 2022 Apr;14(9):2126
p53 at the crossroad of DNA replication and ribosome biogenesis stress pathways. Lindström MS, Bartek J, Maya-Mendoza A Cell Death Differ 2022 May;29(5):972-982
The exon-junction complex helicase eIF4A3 controls cell fate via coordinated regulation of ribosome biogenesis and translational output. Kanellis DC, Espinoza JA, Zisi A, Sakkas E, Bartkova J, Katsori AM, Boström J, Dyrskjøt L, Broholm H, Altun M, Elsässer SJ, Lindström MS, Bartek J Sci Adv 2021 08;7(32):eabf7561
SFRP2 induces a mesenchymal subtype transition by suppression of SOX2 in glioblastoma. Guo M, Goudarzi KM, Abedi S, Pieber M, Sjöberg E, Behnan J, Zhang XM, Harris RA, Bartek J, Lindström MS, Nistér M, Hägerstrand D Oncogene 2021 08;40(32):5066-5080
Identification of functionally distinct and interacting cancer cell subpopulations from glioblastoma with intratumoral genetic heterogeneity. Guo M, van Vliet M, Zhao J, de Ståhl TD, Lindström MS, Cheng H, Heller S, Nistér M, Hägerstrand D Neurooncol Adv ;2(1):vdaa061
Peuget S, Zhu J, Sanz G, Singh M, Gaetani M, Chen X, et al Cancer Res. 2020 Apr;80(7):1538-1550
The antimalarial drug amodiaquine stabilizes p53 through ribosome biogenesis stress, independently of its autophagy-inhibitory activity. Espinoza JA, Zisi A, Kanellis DC, Carreras-Puigvert J, Henriksson M, Hühn D, et al Cell Death Differ. 2020 Feb, 27(2):773-789
Nucleolus as an emerging hub in maintenance of genome stability and cancer pathogenesis. Lindström MS, Jurada D, Bursac S, Orsolic I, Bartek J, Volarevic S Oncogene 2018 05;37(18):2351-2366
Reduced Expression of PROX1 Transitions Glioblastoma Cells into a Mesenchymal Gene Expression Subtype. Goudarzi KM, Espinoza JA, Guo M, Bartek J, Nistér M, Lindström MS, et al Cancer Res. 2018 10;78(20):5901-5916
Induction of the 5S RNP-Mdm2-p53 ribosomal stress pathway delays the initiation but fails to eradicate established murine acute myeloid leukemia. Jaako P, Ugale A, Wahlestedt M, Velasco-Hernandez T, Cammenga J, Lindström MS, et al Leukemia 2017 01;31(1):213-221
NPM1 histone chaperone is upregulated in glioblastoma to promote cell survival and maintain nucleolar shape. Holmberg Olausson K, Elsir T, Moazemi Goudarzi K, Nistér M, Lindström MS Sci Rep 2015 Nov;5():16495
Loss of nucleolar histone chaperone NPM1 triggers rearrangement of heterochromatin and synergizes with a deficiency in DNA methyltransferase DNMT3A to drive ribosomal DNA transcription. Holmberg Olausson K, Nistér M, Lindström MS J. Biol. Chem. 2014 Dec;289(50):34601-19
Disruption of the 5S RNP-Mdm2 interaction significantly improves the erythroid defect in a mouse model for Diamond-Blackfan anemia. Jaako P, Debnath S, Olsson K, Zhang Y, Flygare J, Lindström MS, et al Leukemia 2015 Nov;29(11):2221-9
mTOR inhibitors blunt the p53 response to nucleolar stress by regulating RPL11 and MDM2 levels. Goudarzi KM, Nistér M, Lindström MS Cancer Biol. Ther. 2014 ;15(11):1499-514
Targeting of MCL-1 kills MYC-driven mouse and human lymphomas even when they bear mutations in p53. Kelly GL, Grabow S, Glaser SP, Fitzsimmons L, Aubrey BJ, Okamoto T, et al Genes Dev. 2014 Jan;28(1):58-70
p53 -Dependent and -Independent Nucleolar Stress Responses. Holmberg Olausson K, Nistér M, Lindström MS Cells 2012 Oct;1(4):774-98
NPM1/B23: A Multifunctional Chaperone in Ribosome Biogenesis and Chromatin Remodeling. Lindström MS Biochem Res Int 2011 ;2011():195209
Brain abnormalities and glioma-like lesions in mice overexpressing the long isoform of PDGF-A in astrocytic cells. Nazarenko I, Hedrén A, Sjödin H, Orrego A, Andrae J, Afink GB, et al PLoS ONE 2011 Apr;6(4):e18303
An ARF-independent c-MYC-activated tumor suppression pathway mediated by ribosomal protein-Mdm2 Interaction. Macias E, Jin A, Deisenroth C, Bhat K, Mao H, Lindström MS, et al Cancer Cell 2010 Sep;18(3):231-43
Targeted inactivation of Mdm2 RING finger E3 ubiquitin ligase activity in the mouse reveals mechanistic insights into p53 regulation. Itahana K, Mao H, Jin A, Itahana Y, Clegg HV, Lindström MS, et al Cancer Cell 2007 Oct;12(4):355-66
Cancer-associated mutations in the MDM2 zinc finger domain disrupt ribosomal protein interaction and attenuate MDM2-induced p53 degradation. Lindström MS, Jin A, Deisenroth C, White Wolf G, Zhang Y Mol. Cell. Biol. 2007 Feb;27(3):1056-68
Essential role of the B23/NPM core domain in regulating ARF binding and B23 stability. Enomoto T, Lindström MS, Jin A, Ke H, Zhang Y J. Biol. Chem. 2006 Jul;281(27):18463-72
Myc and E2F1 induce p53 through p14ARF-independent mechanisms in human fibroblasts. Lindström MS, Wiman KG Oncogene 2003 Aug;22(32):4993-5005
p14ARF homozygous deletion or MDM2 overexpression in Burkitt lymphoma lines carrying wild type p53. Lindström MS, Klangby U, Wiman KG Oncogene 2001 Apr;20(17):2171-7
Granskare av manus
Oncogene, Nature, EMBO Rep, EMBO J, Nature Cell Biology, J Biol Chem, Mol Cell Biol, Proteins, J. of Clinical Investigation, Mol Cell, Intl. J of Cancer, Int J Mol Sciences, Cancer, Cancers, BioEssays, J Cytology & Histology, J Mol Biol, PLoS One, FEBS Letters, FEBS J, Future Oncology, Cell Proliferation, Biochem J, Nature Scientific Reports, Tumor Biology, Current Drug Targets, Cytotherapy, Nature Communications, J Cell Science, Cell Reports, Cell Cycle, Chemistry Biology (Cell press), Blood, Pharmaceuticals, Biochem Soc Trans, Cells, Oncotarget, Int J of Dev Neuroscience, Cellular Physiology and Biochemistry, BMC Biotechnology, BMC Molecular Biology, Bioscience Reports, Cancer Res, Elife, J Cellular Physiology, Metabolites, EBiomedicine, ACS Chemical Biology, BBA Molecular Res, Communications Biol, BioEssays och många fler.
Pedagogiska meriter
Handledning doktorander
Huvudhandledare:
Dr Kaveh Moazemi Goudarzi, PhD, 2018-04-27, KI
Dr Asimina Zisi, PhD, 2022-10-28, KI
Bihandledare:
Dr Tamador Elsir, PhD 2010-06-04, KI
Dr Inga Nazarenko, PhD 2011-09-30, KI
Dr Karl Holmberg-Olausson, PhD 2015-06-01, KI
Kurser
Högskolepedagogisk grundkurs GHPH09, 2009, KI; Träningskurs för doktorandhandledare, KI; Ledarskapsutbildning “UGL”, KI
Undervisning
Omfattande undervisning (> 600 timmar ) på läkarlinjen (biokemi intermediärmetabolism, digestion, DFM1 kursen term 1 seminarier, föreläsningar, projekt, projektexamination och tentamen), och biomedicinprogrammet (seminarier, PBL handledare, lab undervisning inom onkologi-tumörbiologi och cell biologi) samt inbjuden föreläsare på ett stort antal doktorandkurser om cancercellers metabolism, cancer stamceller, cancer cell cykel, apoptosis och biobanker inom cancerforskningen.
Förhandsgranskare av doktorsavhandlingar (betygsnämndsledamot)
Dr Ivailo Simoff, PhD, SU, 2009; Dr Jitendra Badhai, PhD, UU, 2009; Dr Chiou-Nan Shiue, PhD, KI, 2010; Dr Ann Sofie Fröjmark, PhD, UU, 2010; Dr Jelena Polajeva, PhD, UU 2012; Dr Deniz Özata, PhD, KI, 2015; Anahita Hamadi, PhD, UU, 2015; Vasil Savov, PhD, UU 2016; Chang Liu, PhD, KI; 2016; Xianli Shen, PhD KI, 2017; Fredrik Lackmann, PhD SU, 2017; H.A. M. Sakil, PhD KI, 2017, Patrick Sculicia, PhD KI 2020; Chiara Pederiva, PhD, KI 2021.
Halvtidsnämnd vid PhD
Erik Berglund KI, 2013; Lei Zhang, UU, 2012 Yuan Xie, UU 2013; Vasil Savov, UU 2014; Emarndeena Cheteh Haji, KI, 2014; Xianli Shen, KI 2014; Amir Mahani, KI, 2014; Anna Sjösten, UU 2015; Mohammed Mustaq, KI, 2014; Honglei Zhao, KI, 2016; Dalel Saidi, KI, 2016; Satendra Kumar, KI, 2016; Chiara Pederiva, KI, 2017; Patrick Sculicia, KI. 2017; Nadilly Bonagas KI 2019, Jemina Lehto KI 2019, Bishoy Hanna KI 2020, m fl
Examinator eller handledare för ett stort antal master och bachelor studenters projekt.
Ordförande vid disputation
Cecilia Nordfors, PhD, KI, 2015; Michael Mints PhD, KI, 2015; Elin Sjöberg PhD, KI, 2015; Min Guo PhD, KI 2020; Bishoy Hanna PhD, KI 2021.
Fakultetsopponent
Amir Nematollani Mahani, KI, Dept LabMed, 2018-06-20.
Utbildning
Magisterexamen, Biomedicin, Karolinska Institutet, 1999
Medicine Doktorsexamen, Onkologi-Exp Onkologi, Karolinska Institutet, 2004
Docent i Experimentell Patologi, Karolinska Institutet, 2012
Akademiska priser och utmärkelser
Swedish Research Council (VR), Young Researcher award, 2012-2014
Postdoctoral fellowship awarded by the Swedish Cancer Society (Cancerfonden), 2007 - 2010.
SSMF awarded but declined 2007
Postdoctoral fellowship awarded by the Swedish Research Council (VR), 2005-2006.
Grants from among others: Swedish Research Council, Radiumhemmets funds, Magnus Bergvall foundation, Åke Wiberg foundation during the years 2008-2019